Ֆտորկինոլոնների լայն կիրառմամբ, բակտերիաների դիմադրությունը և անբարենպաստ ռեակցիաները նույնպես առաջացել են մեկը մյուսի հետևից:Նոր շուկայահանված ֆտորկինոլոնները, ինչպիսին է temafloxacin-ն է, դադարեցվել է միայն 1992 թվականին Մեծ Բրիտանիայում դրանց վաճառքից 15 շաբաթ անց՝ անբարենպաստ ռեակցիաների պատճառով, ինչպիսիք են ալերգիան, արյունահոսությունը և երիկամային անբավարարությունը:Հետևաբար, այնպես չէ, որ որքան բարձր է ճարպային լուծելիությունը և որքան երկար է կիսատ կյանքը, այնքան լավ, և ֆարմակոկինետիկան և կլինիկական առավելություններն ու թերությունները պետք է համակողմանիորեն դիտարկվեն: