Flumequin je členem chinolonového antibakteriálního činidla, které se používá jako velmi důležité antiinfekční činidlo v klinickém veterinárním a vodním přípravku pro své široké spektrum, vysokou účinnost, nízkou toxicitu a silnou penetraci tkání.Používá se také k léčbě onemocnění, prevenci a podpoře růstu.Vzhledem k tomu, že může vést k rezistenci vůči léčivům a potenciální karcinogenitě, jejíž vysoký limit uvnitř živočišné tkáně byl předepsán v EU, Japonsko (v EU je nejvyšší limit 100 ppb).
V současnosti jsou spektrofluorometr, ELISA a HPLC hlavními metodami pro detekci flumequinového zbytku a ELISA je rutinní metoda pro vysokou citlivost a snadnou obsluhu.