Flumequin ist ein Mitglied des Chinolon-Antibiotikums, das aufgrund seines breiten Wirkungsspektrums, seiner hohen Wirksamkeit, geringen Toxizität und starken Gewebepenetration als sehr wichtiges Antiinfektivum in klinischen Veterinär- und Aquarienprodukten verwendet wird.Es wird auch zur Krankheitstherapie, Prävention und Wachstumsförderung eingesetzt.Weil es zu Arzneimittelresistenz und potenzieller Karzinogenität führen kann, deren Höchstgrenze in tierischem Gewebe in der EU, Japan, vorgeschrieben ist (die Höchstgrenze beträgt 100 ppb in der EU).
Gegenwärtig sind Spektrofluorometer, ELISA und HPLC die Hauptmethoden zum Nachweis von Flumequin-Rückständen, und ELISA ist aufgrund der hohen Empfindlichkeit und einfachen Handhabung eine Routinemethode.