Med den udbredte anvendelse af fluorquinoloner er bakteriel resistens og bivirkninger også opstået efter hinanden.Nyligt markedsførte fluoroquinoloner såsom temafloxacin blev afbrudt kun 15 uger efter, at de blev lanceret i Storbritannien i 1992 på grund af bivirkninger såsom allergi, blødning og nyresvigt.Derfor er det ikke sådan, at jo højere fedtopløselighed og jo længere halveringstid, jo bedre, og farmakokinetikken og de kliniske fordele og ulemper bør overvejes omfattende.